1673an zeuden sei ermitak Irun-en: Santa Elena, San Marcial, San Antonio, Labakia, Sto. Cristo de Elizatxo eta San Antón.

Santa Elenakoa dago erabilitako espazio erlijiosoetako bat bai duela hogei mendetatiko gurtza-lekua bezala kontuan hartuta.

Bere barnea barne hartzen duen garrantzitsuena dira hilerri zaharreko hondarrak eta eliza kristau bezala Erdi Aroko garaian erabili zen I mendeko tenplu erromatarra.

Ermita Estebenea-ren estropadaren ertzean aurkitzen da.

Lau urretarako teilatuarekiko eraikin angeluzuzena eta harlandu harresiak dira. Gurtza-lekua izan zen zaharretatik. 70 urteetan zehar egindako indusketek baimendu zuten ehun errausketa-hautetsontzi baino gehiagorekiko garai erromatarreko nekropoli bat eta I mendearen aurreko tenplu erromatarreko hondarrak aurkitzea.

Ermita gero bihurtu da museoa, in situ aurkitutako hondarrak adierazten diren tokian.  
Estilo isabeldarreko, portada da XIX. 
 

Gipuzkoan aurkitutako X mendeko ermita bakarra da. Hainbat aldi berreraiki zen. 1667ko garrantzitsuena.
1972ko maiatzean Aranzadi Zientzia Sozietateak zorupearen esplorazioa hasi zuen, I mendeetako nekropoli erromatarra aurkituz eta II K.o. eta tenplu indigenako hondarrak.
1694ko dokumentu batean agerian jartzen den bezala, ermitaren hurbiltasunetan zegoen popularki "Santutxo-ko-a" bezala ezagututako humilladero artistikoa. Humilladero-ak leku debotoa ziren, gurutze batekin edo bere auzotarren aldetik erruki erakusgarri bezala eraikitzen zen irudiarekin, herrietako sarrerara.

Santa Elenako ermita Meaka-ko auzoaren mugen barruan aurkitzen da eta kokatuta dago Dunboa Ermita / Ermita Karrika Kaleko Kanalaren ondoan.

Nazio-Monumentu Historiko Artistikoa deklaratu zen 1984ko Uztailaren 17an.